Trmo-flox Mouse
Common Name
Trmo-flox
제품 ID
S-CKO-16103
Backgroud
C57BL/6JCya
품종 계통계통 ID
CKOCMP-74753-Trmo-B6J-VA
상태
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연령
Genotype
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기본 정보
품종 계통
Trmo-flox
품종 계통계통 ID
CKOCMP-74753-Trmo-B6J-VA
유전자명
제품 ID
S-CKO-16103
유전자 별칭
Nap1, 5830415F09Rik
배경
C57BL/6JCya
NCBI ID
변형 내용
Conditional knockout
염색체
Chr 4
Phenotype
Datasheet
적용 분야
--
품종 계통 설명
Ensembl 전사체 ID
ENSMUST00000086563
NCBI 전사체 ID
NM_029086
타겟 영역
Exon 2
유효 영역 크기
~0.9 kb
유전자 연구 개요
Trmo, also known as yaeB in Escherichia coli, is a tRNA methyltransferase. It belongs to the Class VIII of AdoMet-dependent methyltransferases and is responsible for the N6-methylation of N6-threonylcarbamoyladenosine (m6t6A) in tRNAs [2]. This modification is crucial for efficient decoding of ACY codons in tRNA(Thr), ensuring proper translation. It may also be involved in broader metabolic and signal-transduction-related pathways as it was identified among genes associated with differentiated thyroid carcinoma (DTC) [1].
In E. coli, deletion of the trmO gene led to the conversion of m6t6A to cyclic t(6)A (ct(6)A), indicating that t(6)A is a common precursor for both m6t6A and ct(6)A. Also, N6-methylation of t(6)A by TrmO enhanced the attenuation activity of the thr operon, suggesting its role in efficient decoding [2]. In silico studies on a hypothetical protein from Pasteurella multocida with a tRNA (adenine (37)-N6)-methyltransferase TrmO functional domain showed its interaction with SAM and SAH, crucial metabolites in tRNA methylation, providing evidence for its possible role as an SAM-dependent MTase [3].
In conclusion, Trmo is an important tRNA methyltransferase for proper tRNA modification and translation efficiency. Its identification in DTC-associated gene loci implies a potential role in this disease. Studies on Trmo in bacteria and in silico models contribute to understanding its biological functions and its possible implications in human diseases like DTC.
References：
1. Kulkarni, Om, Sugier, Pierre-Emmanuel, Guibon, Julie, Truong, Thérèse, Lesueur, Fabienne. 2021. Gene network and biological pathways associated with susceptibility to differentiated thyroid carcinoma. In Scientific reports, 11, 8932. doi:10.1038/s41598-021-88253-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33903625/
2. Kimura, Satoshi, Miyauchi, Kenjyo, Ikeuchi, Yoshiho, Crécy-Lagard, Valérie de, Suzuki, Tsutomu. 2014. Discovery of the β-barrel-type RNA methyltransferase responsible for N6-methylation of N6-threonylcarbamoyladenosine in tRNAs. In Nucleic acids research, 42, 9350-65. doi:10.1093/nar/gku618. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25063302/
3. Masum, Md Habib Ullah, Rajia, Sultana, Bristi, Uditi Paul, Rahaman, Md Mizanur, Saha, Otun. 2023. In Silico Functional Characterization of a Hypothetical Protein From Pasteurella Multocida Reveals a Novel S-Adenosylmethionine-Dependent Methyltransferase Activity. In Bioinformatics and biology insights, 17, 11779322231184024. doi:10.1177/11779322231184024. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37424709/
품질 관리 기준
정자 검사
동결 보존 전: 정자 농도 측정 및 정자 생존율 평가.
동결 보존 후: 각 배치에서 동결 보존된 정자 바이알 1개를 선택하여 체외수정(in vitro fertilization)에 사용합니다.
Environmental Standards:
SPFAvailable Region:
GlobalSource:
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